在西班牙建立一座皇家美术学院的构想是由画家安东尼奥∙梅兰德兹提出的。1726年，他建议腓力五世设立一座设计、绘画、雕塑和建筑艺术学院。

圣费尔南多皇家美术学院博物馆非常靠近太阳门，目前拥有超过1400幅绘画、600座雕塑和15000幅素描，以及由挂毯、银器、陶瓷、瓷器、钟表、家具和奖牌组成的精美装饰艺术收藏。此外，博物馆还有一个永久摄影厅，展出构成学院博物馆摄影收藏的近3000张照片中的一小部分。在这里展出的照片包括西班牙摄影大师的作品，比如Charles Clifford、Ramón Masats、Paco Gómez、Gabriel Cualladó、Castro Prieto、García Alix、Isabel Muñoz、Ouka Leele、Manuel Outumuro、Chema Madoz和Carlos Pérez Siquier等。

学院的永久收藏包含西班牙、意大利和佛兰德艺术的杰作。博物馆保留了自1780年成为其成员的戈雅的13幅绘画，包括两幅自画像（值得一提的是《Autorretrato ante el caballete》，该艺术家唯一一幅表现他在画室里的作品）、《Corrida de Toros》、Moratín的肖像画、《Juan de Villanueva》、女演员《La Tirana》以及反映嘉年华场景的《Entierro de la Sardina》。自2022年6月以来，由于Callia基金会通过拉丁美洲Mecenazgo奖的捐赠，博物馆得以翻新，可以在博物馆一楼的两个主厅欣赏他的作品，将戈雅的展览空间翻了一番。

学院内建有博物馆、档案-图书馆、铸模作坊和国家雕刻院，后者汇集了西班牙最重要艺术家非凡的雕刻作品，其中包括Francisco de Goya的蚀刻铜版画，是版画历史上的杰作。